In der Geschichte Japans waren die Zeiten, als die Herrscher der begünstigte die Ausbreitung des Christentums, und Zeiten, in denen auch aus übersee Lehre fand in Ungnade, und seine Anhänger wurden grausam verfolgt. In dem XV und XVI Jahrhundert das Christentum verbreiteten sich rasch auf den Inseln des Archipels, aber am Ende des XVI Jahrhunderts war verboten, und die Menschen in Japan haben Sie es heimlich. Die Bewohner von Nagasaki waren gezwungen, jedes Jahr beweisen, dass Sie keine Christen sind. Sie schlugen gegen das Bild von Jesus Christus und der Gottesmutter, und dieses Ritual mussten Sie Durchlaufen bis zur Mitte des XIX Jahrhunderts. Insgesamt war das Christentum die Bereiche sind Nichtraucherzonen) in Japan auf zwei seit einem halben Jahrhundert, in dieser Zeit wurden hingerichtet, gefoltert oder ausgewiesen Tausende von Menschen, bekennende diese Religion.

Am 5. Februar 1597 Jahres in Nagasaki öffentlich hingerichtet wurden für die Missionsarbeit 26 Menschen, darunter 20 Japaner, die vier Spanier, und auch der Mexikaner und der Inder. Auf Befehl der dann Shogun Hideyoshi Toyotomi Verhafteten Christen gefoltert, dann führte in Nagasaki und gekreuzigt auf den kreuzen, die auf einem Hügel Нисидзака. Nach dem Tod der gefallenen Märtyrer geworden zu Lesen als die Heiligen und anzuerkennen, daß Ihnen verschiedene wunderbaren Taten. Hundert Jahre nach Ihrer Heiligsprechung im Jahr 1962 auf einem Hügel geöffnet wurden Denkmal und Museum. Am 6. Februar die Katholische Kirche in Japan feiert Ihr Gedächtnis.

In der Sammlung des Museums enthält wichtige historische Dokumente, die aus Europa mitgebracht und die in Japan selbst, die Werke der Kunst der frühen Christentums in Japan. Belichtung in chronologischer Reihenfolge vorgestellt, um die Besucher mit der Periode des frühen Christentums, in Zeiten der Verfolgung von Christen und geheime Leben der Katholiken in der Zeit der Selbstisolierung des Staates.

In der heutigen Zeit das Christentum ist die Dritte der großen Religionen in Japan nach dem Buddhismus und Shinto. Jahrhunderts waren etwa 2, 5 Millionen Christen, vor allem Katholiken.